存根联应当由开具发票的单位和个人保存5年，不得擅自损毁。保存期满，报经税务机关查验后销毁。存根联是票据凭证的一种，属于原始凭证(自己知道记账凭证)，与票据联、抵消联、记账联组合成四联票据。
《中华人民共和国发票管理办法》第二十七条开具发票的单位和个人应当建立发票使用登记制度，设置发票登记簿，并定期向主管税务机关报告发票使用情况。
《中华人民共和国发票管理办法》第二十九条开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。
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