厦门廉租房租赁合同丢了可以到当地人民政府住房保障主管部门申请补办，市、县级人民政府住房保障主管部门会同有关部门审核承租人身份信息与租赁状况的真实性，核实无误准予补办。
《廉租住房保障办法》第四条国务院建设主管部门指导和监督全国廉租住房保障工作。县级以上地方人民政府建设（住房保障）主管部门负责本行政区域内廉租住房保障管理工作。廉租住房保障的具体工作可以由市、县人民政府确定的实施机构承担。县级以上人民政府发展改革（价格）、监察、民政、财政、国土资源、金融管理、税务、统计等部门按照职责分工，负责廉租住房保障的相关工作。
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