没有土地使用权证的房屋所有权证的效力是可以认定为有效。房屋转让应当向房产管理部门申请房产变更登记，凭变更后的房屋所有权证书向土地管理部门申请土地使用权变更登记、更换土地使用权证书。
《城市房地产管理法》第六十一条
在依法取得的房地产开发用地上建成房屋的，应当凭土地使用权证书向县级以上地方人民政府房产管理部门申请登记，由县级以上地方人民政府房产管理部门核实并颁发房屋所有权证书。房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。
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