属于合法房屋的小产权房的长租合同有效。对于历史遗留的无证小产权房可以出租,租赁合同应认定为有效;对于没有任何合法手续属于非法建筑物的小产权房不得出租,租赁合同无效。
《商品房屋租赁管理办法》第六条有下列情形之一的房屋不得出租:
(一)属于违法建筑的;
(二)不符合安全、防灾等工程建设强制性标准的;
(三)违反规定改变房屋使用性质的;
(四)法律、法规规定禁止出租的其他情形。