农村非法转让土地使用权的处罚是由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得并处罚款。转让土地使用权的转让人必须是依法取得国有土地使用权的受让人，同时必须按照转让合同的约定支付转让金，土地使用权的转让不得违反合同的规定。
《土地管理法》第八十二条
擅自将农民集体所有的土地通过出让、转让使用权或者出租等方式用于非农业建设，或者违反本法规定，将集体经营性建设用地通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得，并处罚款。
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