购房发票第二联丢了还能办房产证。购房者可以率先到房屋所在地的税务部门申请代开不动产统一销售票据；或者向住建局说明情况，到银行打印流水、开具证明，亦可证明房屋买卖事实关系。
《不动产登记暂行条例》第十三条不动产登记簿由不动产登记机构永久保存。不动产登记簿损毁、灭失的，不动产登记机构应当依据原有登记资料予以重建。行政区域变更或者不动产登记机构职能调整的，应当及时将不动产登记簿移交相应的不动产登记机构。
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