私自在楼顶建房违法。产权单位在建设申报过程中对楼顶建筑物一般不进行申报，规划局不予审批相关楼顶建设项目。楼顶建房侵害其他业主的公共权益、堵塞消防通道，凡是楼顶建筑均属于不合法建筑。
《土地管理法》第五十九条
乡镇企业、乡镇村公共设施、公益事业、农村村民住宅等乡镇村建设，应当按照村庄和集镇规划，合理布局，综合开发，配套建设；建设用地，应当符合乡镇土地利用总体规划和土地利用年度计划，并依照本法第四十四条、第六十条、第六十一条、第六十二条的规定办理审批手续。
第六十二条
农村村民建住宅，应当符合乡镇土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡镇土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。农村村民住宅用地，由乡镇人民政府审核批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。
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