补申报要罚款。补报工商年报要罚款，会罚款3万元以下。逾期未申报年报会被纳入异常名录，这个不良记录伴随企业终生，就算后期补报了工商年报记录也会一直存在，而且连续三年未申报企业工商年报，公司会被吊销且无法恢复正常，只能走注销流程。
《税收征收管理法》第二十五条
纳税人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实办理纳税申报，报送纳税申报表、财务会计报表以及税务机关根据实际需要要求纳税人报送的其他纳税资料。
扣缴义务人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实报送代扣代缴、代收代缴税款报告表以及税务机关根据实际需要要求扣缴义务人报送的其他有关资料。
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