船舶国籍证书过期的办理方式是携带身份证、已经过期的船舶国籍证书等资料去海事局重新办理。船舶经依法登记，取得中华人民共和国国籍，方可悬挂中华人民共和国国旗航行。
《中华人民共和国船舶登记条例》第三条
船舶经依法登记，取得中华人民共和国国籍，方可悬挂中华人民共和国国旗航行；未经登记的，不得悬挂中华人民共和国国旗航行。
第四条
船舶不得具有双重国籍。凡在外国登记的船舶，未中止或者注销原登记国国籍的，不得取得中华人民共和国国籍。
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