电商食品经营许可证在营业执照的所属地申请办理。需要注意当事人应该先办营业执照，再办食品经营许可证，食品经营许可证有效期一般是五年。申请办理食品经营许可证，需要携带食品经营许可申请书、营业执照副本原件、公章、u盾。
《中华人民共和国电子商务法》第十条
电子商务经营者应当依法办理市场主体登记。但是，个人销售自产农副产品、家庭手工业产品，个人利用自己的技能从事依法无须取得许可的便民劳务活动和零星小额交易活动，以及依照法律、行政法规不需要进行登记的除外。
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