行为人涉嫌强奸但是没证据证明的，如果失去直接证据的，可以用间接证据进行证明。除了强行发生关系的直接证据之外，同时也要有间接证据证明，和对方发生性关系是违背意愿的。如果身上有伤的，也可以在一定程度上证明不是自愿的。
构成强奸罪，需要证据确实充分、查证属实并且排除合理怀疑的证据，对强奸罪的客观违法要件以及主观的责任要件构成要件的事实进行认定。如果一个强奸案没有充分的证据证明，那么行为人就会依据疑罪从无而判决为罪名不能成立，逃脱刑事的追究。
《刑事诉讼法》第五十条
可以用于证明案件事实的材料，都是证据。
证据包括：
（一）物证；
（二）书证；
（三）证人证言；
（四）被害人陈述；
（五）犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解；
（六）鉴定意见；
（七）勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录；
（八）视听资料、电子数据。
证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。
【法律分析】：被强奸没证据的，如果身上有伤也可以在一定程度上证明不是自愿的。可以及时保存现场遗留物，嫌疑人的毛发，留有嫌疑人体液的物品等，提交给公安机关。也可以直接报案，由公安机关勘察现场，搜集证据，对被害人进行法医鉴定等。被强奸没有证据不可以立案的，因此被侵犯后，搜集保留证据很重要，否而没有证据立不了案，就会让坏人逍遥法外。
【法律依据】：《中华人民共和国刑法修正案》 二十六、 将刑法第二百三十六条修改为：“以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。“奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。“强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：“（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；“（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；“（三）在公共场所当众强奸妇女、奸淫幼女的；“（四）二人以上轮奸的；“（五）奸淫不满十周岁的幼女或者造成幼女伤害的；“（六）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。”
强奸罪没有证据了可以再收集其他证据，因此没有证据指控犯罪的则只能判无罪。证据确实、充分，应当符合以下条件：定罪量刑的事实都有证据证明；据以定案的证据均经法定程序查证属实；综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。根据相关法律规定，对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。
法律依据
《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条 对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。证据确实、充分，应当符合以下条件：(一)定罪量刑的事实都有证据证明(二)据以定案的证据均经法定程序查证属实(三)综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。
报警肯定是首要选择，但要确立强奸需要确认的几个基本事实： 1、强奸违背当事人意志而为的行为，要证明当时有醉酒，意识不清，找到相应的证人（夜场上班的也没关系，只要实话实说，能够与其他证据相互印证就可以），警方调取相应的录像基本可以弄清；
2、、男女间关系不暧昧（不然男方狡辩），但如果说身体有明显的伤痕（强迫行为引发的肢体冲突，留下伤痕），或是衣服明显的撕裂痕迹；
3、做身体检查，到底对方有没留下罪证。
强奸罪没有证据了可以再收集其他证据，因此没有证据指控犯罪的则只能判无罪。证据确实、充分，应当符合以下条件：定罪量刑的事实都有证据证明；据以定案的证据均经法定程序查证属实；综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。
《刑事诉讼法》第五十五条
对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。
证据不足的强奸案子应这样处理：检察院认为证据不足的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查，但补充侦查以二次为限。人民法院认为证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
《刑事诉讼法》第一百七十五条
人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。
人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。
对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
第二百条
在被告人最后陈述后，审判长宣布休庭，合议庭进行评议，根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出以下判决：
（三）证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
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