行政处罚决定书中的瑕疵可以由发现后由行政机关主动通知当事人进行主动纠正。《行政处罚法》规定行政机关对于违法行为必须全面、客观、公正地调查，收集有关证据；必要时，依照法律、法规的规定，可以进行检查，避免违法行政。
《《中华人民共和国行政处罚法》》第五十四条
除本法第五十一条规定的可以当场作出的行政处罚外，行政机关发现公民、法人或者其他组织有依法应当给予行政处罚的行为的，必须全面、客观、公正地调查，收集有关证据；必要时，依照法律、法规的规定，可以进行检查。
符合立案标准的，行政机关应当及时立案。
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