鉴定程序严重违法包括应当回避却没有回避；超时限询问查证，刑讯逼供；先裁决后取证；非法搜查；执法人员未取得相应执法资格；采取利诱、欺诈、胁迫、暴力等不正当手段等。
《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第四十条
当事人申请重新鉴定，存在下列情形之一的，人民法院应当准许：
（一）鉴定人不具备相应资格的；
（二）鉴定程序严重违法的；
（三）鉴定意见明显依据不足的；
（四）鉴定意见不能作为证据使用的其他情形。
存在前款第一项至第三项情形的，鉴定人已经收取的鉴定费用应当退还。拒不退还的，依照本规定第八十一条第二款的规定处理。
对鉴定意见的瑕疵，可以通过补正、补充鉴定或者补充质证、重新质证等方法解决的，人民法院不予准许重新鉴定的申请。
重新鉴定的，原鉴定意见不得作为认定案件事实的根据。
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