存疑不起诉不会开除公职。存疑不起诉是检察机关对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件，而作出的不起诉决定，这种情况下犯罪行为人将被无罪释放，法院不能判处其承担任何的刑罚。
《刑事诉讼法》第一百七十五条
人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。
人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。
对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。
对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
不起诉决定，分为相对不起诉或者存疑不起诉，不管是什么情况，都是检察院直接决定的，没有经过法庭审判程序，即没有被判处刑罚，不用承担相应责任。
所以不会因此被开除公职。但如果事实认定清楚，还是可以依据事实给予开除处分的。
1、开除公职以判处刑罚为前提。而不予起诉是指人民检察院对公安机关侦查终结移送起诉的案件或自行侦查终结的案件，经审查认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或依法不应追究刑事责任的，作出不向人民法院提起公诉的一种决定。不起诉的效力是结束刑事诉讼，犯罪嫌疑人就不会再受到刑法追责从而承担刑事责任了。因此，犯罪嫌疑人也不会被开除公职。
2、【法律依据】
3、《行政机关公务员处分条例》第十七条规定，行政机关公务员依法被判处刑罚的，给予开除处分。
依据我国刑事诉讼法的规定，对于刑事公诉案件而言，检察机关是我国提起刑事公诉的公诉人，检察机关接收刑事案件后，会对案件进行审查，符合条件的就会起诉，公职人员没有被起诉的，就是没有刑事责任，所以是不会被开除公职的。
行政机关公务员违法违纪涉嫌犯罪的，应当移送司法机关依法追究刑事责任。违法违纪的行政机关公务员在行政机关对其作出处分决定前，已经依法被判处刑罚、罢免、免职或者已经辞去领导职务，依法应当给予处分的，由行政机关根据其违法违纪事实，给予处分。行政机关公务员依法被判处刑罚的，给予开除处分。
法律依据
《中华人民共和国行政机关公务员处分条》第十七条 违法违纪的行政机关公务员在行政机关对其作出处分决定前，已经依法被判处刑罚、罢免、免职或者已经辞去领导职务，依法应当给予处分的，由行政机关根据其违法违纪事实，给予处分。
行政机关公务员依法被判处刑罚的，给予开除处分。
《中华人民共和国行政机关公务员处分条例》第五条 行政机关公务员违法违纪涉嫌犯罪的，应当移送司法机关依法追究刑事责任。
恭喜！根据《刑事诉讼法》第16条、177条等法律规定，当事人的行为不构成犯罪或者犯罪情节显著轻微等情形，由人民检察院依法作出不起诉决定的公职人员可以保留公职等职务。因为，《刑事诉讼法》（法律）第12条规定，未经人民法院依法判决，对任何人都不得确定有罪。
同时，根据《公职人员政务处分法》（法律）第14条规定和《劳动合同法》（法律）第39条第6项等法律规定，公职人员因故意犯罪被人民法院依法判处管制、拘役或者有期徒刑以上等刑罚（含宣告缓刑）的，应给予以开除公职等政务处分或者解除劳动合同。
参考资料内容如下：
《中华人民共和国刑事诉讼法》（法律）
第十二条 【法院定罪原则】未经人民法院依法判决，对任何人都不得确定有罪。
第十六条 【依法不追诉原则】有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。
第一百七十七条 犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。
《中华人民共和国公职人员政务处分法》（法律）
第十四条 公职人员犯罪，有下列情形之一的，予以开除：
（一）因故意犯罪被判处管制、拘役或者有期徒刑以上刑罚（含宣告缓刑）的；
（二）因过失犯罪被判处有期徒刑，刑期超过三年的；
（三）因犯罪被单处或者并处剥夺政治权利的。
因过失犯罪被判处管制、拘役或者三年以下有期徒刑的，一般应当予以开除；案件情况特殊，予以撤职更为适当的，可以不予开除，但是应当报请上一级机关批准。
公职人员因犯罪被单处罚金，或者犯罪情节轻微，人民检察院依法作出不起诉决定或者人民法院依法免予刑事处罚的，予以撤职；造成不良影响的，予以开除。
《中华人民共和国劳动合同法》（法律）
（六）法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
不起诉决定作出后 刑事强制措施 应解除。不过，不起诉分为绝对不起诉，相对不起诉和 证据 不足不起诉。 如果是相对不起诉，则可能会面临 行政处罚 《 刑事诉讼法 》 第七十七条人民法院、人民检察院和公安机关对 犯罪嫌疑人 、被告人 取保候审 最长不得超过十二个月， 监视居住 最长不得超过六个月。 在取保候审、监视居住期间，不得中断对案件的侦查、起诉和审理。对于发现不应当追究刑事责任或者取保候审、监视居住期限届满的，应当及时解除取保候审、监视居住。 解除取保候审、监视居住，应当及时通知被取保候审、监视居住人和有关单位。 第一百七十三条犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照 刑法 规定不需要判处 刑罚 或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
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