医疗事故超过三年还能打官司。超过三年虽然已经过了诉讼时效，但是过了诉讼时效仍然可以起诉，只不过因为诉讼时效已经过了，对方可以拥有抗辩权。当对方提出抗辩的时候，原告的诉讼请求会被驳回。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
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