跨市异地就医备案网上办理流程是：携带本人社会保障卡和二代身份证，到参保地医疗保险经办机构，办理异地就医登记备案，然后填写《基本医疗保险异地就医登记表》；查询备案医院是否在异地就医住院费联网直接结算定点医疗机构名单里；最后核对参保地医保经办机构。
《中华人民共和国社会保险法》第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
《中华人民共和国社会保险法》第三十二条
个人跨统筹地区就业的，其基本医疗保险关系随本人转移，缴费年限累计计算。
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