医疗事故司法鉴定费用的缴纳方式是：
1、经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；
2、不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。
《医疗事故处理条例》第三十四条
医疗事故技术鉴定，可以收取鉴定费用。经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。鉴定费用标准由省、自治区、直辖市人民政府价格主管部门会同同级财政部门、卫生行政部门规定。
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