医疗纠纷处理协议无效的情形如下：医疗纠纷处理协议违反法律、行政法规的强制性规定。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。比如说行为人不具备相应的民事行为能力的话，医疗纠纷处理协议是无效的。
《民法典》第一百五十三条
违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
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