处罚决定书扣分是当时扣的。交警开罚单时一般都是用警务通开的，警务通开的罚单是实时上传的，所以一般是开好罚单时就已经扣了分了，但全国并不统一，机动车违章从违法行为发生到录入到网上是有个过程的。
《道路交通安全法》第八十九条
行人、乘车人、非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的，可以扣留其非机动车。
第九十条
机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。
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