软件著作权侵权属于民事侵权，一般处理如下：可以与著作权人协商和解；可以请求知识产权行政部门者依法成立的其他调解组织调解；根据与著作权人达成的仲裁协议提请仲裁机构仲裁；通过人民法院诉讼依法解决。
《著作权法》第六十条
著作权纠纷可以调解，也可以根据当事人达成的书面仲裁协议或者著作权合同中的仲裁条款，向仲裁机构申请仲裁。当事人没有书面仲裁协议，也没有在著作权合同中订立仲裁条款的，可以直接向人民法院起诉。
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