侵犯商业秘密构成犯罪的，管辖法院应当是应当由犯罪行为发生地，即犯罪预备地、犯罪行为实施地、犯罪结果发生地和销赃地人民法院管辖。行为人有露、使用或者允许他人使用不正当手段获取的权利人的商业秘密等行为的，情节严重的，处三年以下有期徒刑，并处或者单处罚金。
《中华人民共和国刑法》第二百一十九条有下列侵犯商业秘密行为之一，情节严重的，处三年以下有期徒刑，并处或者单处罚金；情节特别严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金：
（一）以盗窃、贿赂、欺诈、胁迫、电子侵入或者其他不正当手段获取权利人的商业秘密的；
（二）披露、使用或者允许他人使用以前项手段获取的权利人的商业秘密的；
（三）违反保密义务或者违反权利人有关保守商业秘密的要求，披露、使用或者允许他人使用其所掌握的商业秘密的。
明知前款所列行为，获取、披露、使用或者允许他人使用该商业秘密的，以侵犯商业秘密论。
本条所称权利人，是指商业秘密的所有人和经商业秘密所有人许可的商业秘密使用人。
侵犯商业秘密管辖法院是：级别管辖为，知识产权纠纷由中级以上人民法院或知识产权法院管辖。地域管辖为，知识产权纠纷由被告所在地或者侵权行为发生地人民法院管辖。
《最高人民法院关于适用的解释》第二条专利纠纷案件由知识产权法院、最高人民法院确定的中级人民法院和基层人民法院管辖。海事、海商案件由海事法院管辖。《中华人民共和国民事诉讼法》第二十八条因侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。第二百六十五条因合同纠纷或者其他财产权益纠纷，对在中华人民共和国领域内没有住所的被告提起的诉讼，如果合同在中华人民共和国领域内签订或者履行，或者诉讼标的物在中华人民共和国领域内，或者被告在中华人民共和国领域内有可供扣押的财产，或者被告在中华人民共和国领域内设有代表机构，可以由合同签订地、合同履行地、诉讼标的物所在地、可供扣押财产所在地、侵权行为地或者代表机构住所地人民法院管辖。
侵犯商业秘密的刑事案件的管辖权和民事案件的管辖权有所不同，从管辖权法院的级别上来说，侵犯商业秘密的刑事案件一般由基层人民法院管辖；从地域管辖上来说，则一般由犯罪行为发生地，即犯罪预备地、犯罪行为实施地、犯罪结果发生地和销赃地人民法院管辖。
由于商业秘密的民事侵权案件的专业性和复杂性，法律规定，商业秘密案件原则上由中级人民法院管辖。但在涉及因违反竞业禁止约定的商业秘密的案件中，则要注意对案件本身的性质加以区分。对于仅仅是劳动者与用人单位因劳动合同法律关系发生的劳动争议案件，应当按照劳动争议的管辖规定，即由用人单位所在地或者劳动合同履行地的基层人民法院管辖。所以商业秘密侵权管辖法院有级别要求的，但需要根据案件的具体情况具体分析。
法律依据:
《中华人民共和国民事诉讼法》
第十七条 基层人民法院管辖第一审民事案件，但本法另有规定的除外。
第十八条 中级人民法院管辖下列第一审民事案件：
(一)重大涉外案件(二)在本辖区有重大影响的案件(三)最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件。
第十九条 高级法院管辖
高级人民法院管辖在本辖区有重大影响的第一审民事案件。
第二十条 最高人民法院管辖下列第一审民事案件：
(一)在全国有重大影响的案件(二)认为应当由本院审理的案件。
第二十一条 对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。
邱戈龙律师认为秘密侵权案件管辖的确定
（一）级别管辖
根据《最高人民法院关于审理不正当竞争民事案件应用法律若干问题的解释》（法释〔2007〕2号）第十八条规定“反不正当竞争法第五条、第九条、第十条、第十四条规定的不正当竞争民事第一审案件，一般由中级人民法院管辖。各高级人民法院根据本辖区的实际情况，经最高人民法院批准，可以确定若干基层人民法院受理不正当竞争民事第一审案件，已经批准可以审理知识产权民事案件的基层人民法院，可以继续受理”。因此，商业秘密侵权案件原则上由中级人民法院管辖，经最高人民法院批准的基层人民法院亦可受理。
（二）地域管辖
由于我国法律对于商业秘密侵权案件的地域管辖问题并未做特殊的规定，因此应适用《民事诉讼法》的一般规定。根据《民事诉讼法》第二十八条规定，“因侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖”。在实务中，一般对于被告住所地无异议，但是对于“侵权行为地”的界定仍存在一定的争议。
然而还有学者认为，《反不正当竞争法》框架下所保护的法益应当是相关市场内的经营者的合法权益，以及有序的社会经济秩序。而若排除侵权产品销售地法院管辖权，则不利于维护商业秘密权利人在相关地域市场内维护其正当竞争利益。如此来保护商业秘密，忽略了在产品销售端对市场秩序的维护，不符合反不正当竞争法的目的和宗旨。
侵犯商业秘密的刑事案件的管辖权和民事案件的管辖权有所不同，从管辖权法院的级别上来说，侵犯商业秘密的刑事案件一般由基层人民法院管辖。
《刑法》第二百一十九条，给商业秘密的权利人造成重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
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