传染毒种扩散罪的立案标准是：从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，导致甲类和按甲类管理的传染病传播的；导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；造成人员重伤或者死亡的；严重影响正常的生产、生活秩序的；其他造成严重后果的情形。
《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第五十条从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
（一）导致甲类和按甲类管理的传染病传播的；
（二）导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；
（三）造成人员重伤或者死亡的；
（四）严重影响正常的生产、生活秩序的；
（五）其他造成严重后果的情形。
传染毒种扩散罪的立案标准为：
1、导致甲类和按甲类管理的传染病传播的；
2、导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；
3、造成人员重伤或者死亡的；
4、严重影响正常的生产、生活秩序的；
5、其他造成严重后果的情形。
中华人民共和国刑法对传染病菌种、毒种扩散罪的立案标准为处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《刑法》第三百三十一条 【传染病菌种、毒种扩散罪】从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《刑法》
第三百三十一条 【传染病菌种、毒种扩散罪】从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
我国刑法对传染病菌种扩散罪的立案规定：《刑事案件立案追诉标准的规定（一）》规定，从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，涉嫌导致甲类和按甲类管理的传染病传播、造成人员重伤或者死亡等情形之一的，应予立案追诉。
后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。根据《中华人民共和国刑法》第三百三十一条：从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《中华人民共和国刑法》
第三百三十一条 从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
新刑法对传染毒种扩散罪的量刑标准为后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《刑法》第三百三十一条 【传染病菌种、毒种扩散罪】从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《刑法》第三百三十一条：从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《中华人民共和国刑法》
第三百三十一条 从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
传染病菌种扩散罪的判刑：从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第三百三十一条 【传染病菌种、毒种扩散罪】从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
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