企业怕劳动仲裁的原因为：
1、在仲裁程序中，对于一些纠纷不大的劳动争议，企业不服的，不得再次提起诉讼；但劳动者不服的却可以再次提起诉讼，另外企业需要承担更多的举证责任及相应的不利后果；
2、在相关法律中，除非是劳动者具有法定过错，否则企业一般不得解除劳动合同，只有符合法定情形用人单位才能解除劳动合同并要支付经济补偿金。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。
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