兼职合同未到期辞职，工资不会被扣除。但劳动者违法解除劳动合同造成用人单位损失的，应当承担赔偿责任。用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
《工资支付暂行规定》第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
《中华人民共和国劳动合同法》第九十条劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
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