工资免税申请流程：登录到当地税务局网站；点击综合所得申报；点击正常工资薪金所得；弹出申报界面，输入员工的工资资料；在减免税额处填写免税的金额；返回到申报主界面，点击减免事项附表；选择减免事项的类型、减免性质，再填写减免税额，最后点击保存；点击申报表报送即可。
《中华人民共和国个人所得税法》第四条第一款第一项
下列各项个人所得，免征个人所得税：
（一）省级人民政府、国务院部委和中国人民解放军军以上单位，以及外国组织、国际组织颁发的科学、教育、技术、文化、卫生、体育、环境保护等方面的奖金。
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