个体工商户年收入100万要交税。个体工商户纳税采用三种税收制度：查账征收的税款；定期定额征收；核定征收。实行查账征收的个体工商户，生产、经营所得，以每一纳税年度的收入总额，减除支出以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
《个体工商户个人所得税计税办法》第二条实行查账征收的个体工商户应当按照本办法的规定，计算并申报缴纳个人所得税。
《个体工商户个人所得税计税办法》第七条个体工商户的生产、经营所得，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用、税金、损失、其他支出以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
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