(一)概念区别商业秘密是企业的财产权利，它关乎企业的竞争力，对企业的发展至关重要，有的甚至直接影响到企业的生存。商业秘密等知识产权可申请紧急保全。专利一般是由政府机关或者代表若干国家的区域性组织根据申请而颁发的一种文件，这种文件记载了发明创造的内容，并且在一定时期内产生这样一种法律状态，即获得专利的发明创造在一般情况下他人只有经专利权人许可才能予以实施。在我国，专利分为发明、实用新型和外观设计三种类型。(二)保护制度设立目的不同商业秘密是秘不示人的秘密武器，通过《反不正当竞争法》保护，目的侧重于维护公平竞争。专利是国家授予的一项合法垄断权，通过《专利法》保护，目的侧重于鼓励创新。(三)保护范围不同从对两者的概念分析可以看到，商业秘密所涵盖的保护范围较为广泛，包括技术信息及经营信息。只要当信息不能被归为“发明、实用新型和外观设计”时均可以作为商业秘密保护，包括但不限于设计方案、可获得专利权的装置或工艺手法，甚至可以是研发过程中的试验记录或是任何将来具有价值的其他信息。专利的保护范围具有一定的局限性，至少有一部分信息是需要公开的，比如说明书、附图、具体实施方式等。(四)取得方式及成本不同专利权基于申请的并经过行政机关公告授权取得，授予专利权的发明和实用新型应当具备新颖性、创造性和实用性并应当在授予专利权后向社会公开。发明专利的期限为二十年，实用新型和外观设计的期限为十年(外观设计有望改为15年)，期满需要缴费来续期。商业秘密的取得无需行政机关审批，只要该信息符合秘密性、保密性和价值性即可(特别说明，新颖性不是商业秘密的构成要件，新颖性是专利制度中的法律概念和专利有权需要符合的条件之一，并不能套用到商业秘密制度上。)，核心技术信息所有人自行采取保密措施。此外，商业秘密没有期限限制，只要拥有者一直持续把某信息当商业秘密对待，该信息从产生之日起立即生效，而且可以一直持续拥有商业秘密的身份，而无需去向任何机构申请登记也无需缴纳任何费用。但看似无须官方成本，而根据“免费的才是最贵的”理论，企业通常为了维护商业秘密需要采取一系列保密措施，这些措施的花费可能是上无封顶的。(五)公开后果不同专利的取得是以公开为前提，是通过公开后取得权利保护。而商业秘密一旦公开，就不再受到保护了。(六)侵权判定原则不同专利侵权通过判断被控侵权技术方案是否落入专利权保护范围来认定，主要是运用相同侵权或等同侵权等原则，被诉侵权技术方案的技术特征与权利要求记载的全部技术特征相比，缺少权利要求记载的一个以上的技术特征，或者有一个以上技术特征不相同也不等同的，人民法院应当认定其没有落入专利权的保护范围。商业秘密侵权判定的原则主要是相同或者实质相似+接触-合法来源，与专利侵权判定不同的是需要判断被控侵权人是否实际或可能接触过权利人的商业秘密。
1.权利的产生方式不同。依民法概念而言，商业秘密的取得属于原始取得，基于权利人自身的智力劳动成果，智力劳动成果一经产生即已获得，无须经他人约束专利权的取得除本身的智力成果的创造，还须依申请获得，即“国务院专利行政统一受理和审查专利申请，依法授予专利权”。部门负责管理全国的专利工作2.两种权利的产生条件不同，即是否对于其技术信息予以公开为取得前提。相较于专利权而言，商业秘密的获得是以不公开技术信息为要件的，即对于技术信息的保密是商业秘密产生的最基本条件。对于专利权而言，其垄断性权利的获得是一项社会公众公开其专利，并与社会签订一项特殊的契约，以此获得权利。故是否公开是两种权利产生的最基本不同条件。
3.获得权利主体范围的区别。通览各国专利法，一项发明只授予一项专利权，专利权的取得采取先申请或先发明的原则，其权利主体是唯一的，其他人以后即使做出相同的发明也不能再取得专利权，也不能自由将其加以使用。而商业秘密权利的获得主体则是没有明确限制的，甚至可以说是竞争性的。只要相互独立的主体之间通过其独立研发、创造或其他的合法手段，取得相同或类似的技术，只要不向外界公布，均可以成为商业秘密权的人。
4.权利的客体范围不同。商业秘密分为技术信息和经营信息，在本文所称的商业秘密特指技术信息。而专利权的客体，即发明、实用新型和外观没计，均属于技术信息的范畴。即使在技术信息领域之内，能成为专利权客体的范围也比能成为商业秘密权客体的范围要小，如动植物新品种门前在我国就不能被授予专利权，而它却可能被当作商业秘密加以保护。此外，专利权的客体只能是完整的技术方案，而商业秘密的客体则更包括未完成的技术方案。
5.商业秘密权和专利权的权利取得要件不同。对于专利权而言，授予专利权的发明和实用新型，应当具备新颖性、创造性和实用性。法律对于专利权的取得要件有着明确而又详细的规定，一项专利的取得将有诸多的限制。而商业秘密由于是以不公开为要件的自动取得，因此，只要有秘密性即可。商业秘密与专利的区别如上
(一)概念区别商业秘密是企业的财产权利，它关乎企业的竞争力，对企业的发展至关重要，有的甚至直接影响到企业的生存。商业秘密等知识产权可申请紧急保全。专利一般是由政府机关或者代表若干国家的区域性组织根据申请而颁发的一种文件，这种文件记载了发明创造的内容，并且在一定时期内产生这样一种法律状态，即获得专利的发明创造在一般情况下他人只有经专利权人许可才能予以实施。在我国，专利分为发明、实用新型和外观设计三种类型。(二)保护制度设立目的不同商业秘密是秘不示人的秘密武器，通过《反不正当竞争法》保护，目的侧重于维护公平竞争。专利是国家授予的一项合法垄断权，通过《专利法》保护，目的侧重于鼓励创新。(三)保护范围不同从对两者的概念分析可以看到，商业秘密所涵盖的保护范围较为广泛，包括技术信息及经营信息。只要当信息不能被归为“发明、实用新型和外观设计”时均可以作为商业秘密保护，包括但不限于设计方案、可获得专利权的装置或工艺手法，甚至可以是研发过程中的试验记录或是任何将来具有价值的其他信息。专利的保护范围具有一定的局限性，至少有一部分信息是需要公开的，比如说明书、附图、具体实施方式等。(四)取得方式及成本不同专利权基于申请的并经过行政机关公告授权取得，授予专利权的发明和实用新型应当具备新颖性、创造性和实用性并应当在授予专利权后向社会公开。发明专利的期限为二十年，实用新型和外观设计的期限为十年(外观设计有望改为15年)，期满需要缴费来续期。(五)公开后果不同专利的取得是以公开为前提，是通过公开后取得权利保护。而商业秘密一旦公开，就不再受到保护了。(六)侵权判定原则不同专利侵权通过判断被控侵权技术方案是否落入专利权保护范围来认定，主要是运用相同侵权或等同侵权等原则，被诉侵权技术方案的技术特征与权利要求记载的全部技术特征相比，缺少权利要求记载的一个以上的技术特征，或者有一个以上技术特征不相同也不等同的，人民法院应当认定其没有落入专利权的保护范围。商业秘密侵权判定的原则主要是相同或者实质相似+接触-合法来源，与专利侵权判定不同的是需要判断被控侵权人是否实际或可能接触过权利人的商业秘密。
法律分析：商业秘密，是不为公众所知悉，能为权利人带来经济利益，具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。商业秘密的"不为公众所知悉"即只要不是在本行业内众所周知的普通信息，能够与普通信息保持最低的秘密或新颖限度的差异的信息，都构成商业秘密。专利是一项发明创造，即发明、实用新型或外观设计向国家专利局提出专利申请，经依法审查合格后，向专利申请人授予的在规定的时间内对该项发明创造享有的专有权。
法律依据：《中华人民共和国反不正当竞争法》 第十条 经营者不得采用下列手段侵犯商业秘密:以盗窃、利诱、胁迫或者其他不正当手段获取权利人的商业秘密披露、使用或者允许他人使用以前项手段获取的权利人的商业秘密违反约定或者违反权利人有关保守商业秘密的要求，披露、使用或者允许他人使用其所掌握的商业秘密。
商业秘密，是指不为公众所知悉、能为权利人带来经济利益，具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。商业秘密是企业的财产权利，它关乎企业的竞争力，对企业的发展至关重要。
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