工伤赔偿和交通事故赔偿在不重复的项目中没有冲突；但是对于重复性的赔偿项目，例如医疗费等，如果交通事故中的第三人已经支付侵权赔偿的，工伤赔偿基金和用人单位不再重复性支付。
《《中华人民共和国社会保险法》》第四十二条由于第三人的原因造成工伤，第三人不支付工伤医疗费用或者无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付。工伤保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。
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