劳动者在疫情期间不上班，如果是与单位协商达成一致才采取的轮岗轮休等稳定工作岗位的措施，不算旷工。或者如果是单位强令劳动者冒险作业，劳动者的工作环境会危害其生命安全和身体健康，劳动者不去上班的也不算作旷工。
《《中华人民共和国劳动合同法》》第三十二条劳动者拒绝用人单位管理人员违章指挥、强令冒险作业的，不视为违反劳动合同。
劳动者对危害生命安全和身体健康的劳动条件，有权对用人单位提出批评、检举和控告。
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