1、主体不同。庭外调查的主体是法院。它特指的是由于当事人因客观原因不能自行收集的证据或人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院依法有责任进行调查和收集。而法庭调查的主体是人民法院、当事人和诉讼代理人。它指的是当事人、诉讼代理人在人民法院的主持下，通过举证、质证、反证、再举证、再反证……向证人、鉴定人、勘验人发问及人民法院认证来完成的法庭调查的过程。
2、方式不同。一般来说，法庭调查除了民诉法中第一百二十条的规定情况外，都是公开进行的，把审判活动置于诉讼参与人和群众的监督下，透明度很高，而庭外调查则是由人民法院两人以上共同进行，大多数情况与当事人是背靠背的，透明度很低。
3、范围不同。“谁主张、谁举证”是民事诉讼的一项重要原则。当事人举证的范围包括能证明自己主张的所有证据和反驳对方主张的所有证据，带有明显的“功利性”。即只举对已有利的证据，无利的则不举。而庭外调查的范围则限于最高院关于适用民诉法若干问题的意见第73条规定的四种情况。可见庭外调查的范围应比法庭调查的范围小得多。而且庭外调查的目的是进一步排除疑问，查清案件事实，并不是为一方当事人服务的。
4、产生的阶段不同。法庭调查特指开庭审理中的一个阶段。除此之外，就不能说是法庭调查了。而庭外调查只能产生在开庭审理前或开庭审理后，而不能产生在开庭审理中。当然，庭外调查，收集的证据最终还要经过开庭审理才能得到确认。
5、主次有别。法庭调查是开庭审理的核心，是民事诉讼的必经阶段，未经法庭调查所确认的证据就不能成为定案的根据。而庭外调查则是法庭调查的必要补充，处于从属的地位。人民法院要根据案件的需要决定是否进行庭外调查。即案件需要时才进行庭外调查，不需要时就不进行庭外调查。庭外调查不是民事诉讼的必经阶段。
1、被告人、被害人有进行陈述的权利。公诉人宣读起诉书后，被告人和被害人可以就起诉书所指控的犯罪分别进行陈述。被告人如果承认起诉书中的指控，应对自己的犯罪行为进行陈述；如果不承认起诉书中的指控，则可提出自己无罪的意见。被害人可以针对起诉书中指控的犯罪陈述自己受害的经过和有关的诉讼请求。
2、被害人、附带民事诉讼的原告人在法庭调查时，经审判长同意，可以向被告人发问。被害人是犯罪行为的直接受害者，附带民事诉讼的原告人对由于被告人的犯罪行为而遭受到的物质损失有权要求赔偿。所以他们可以向被告人发问。
3、当事人经审判长许可，有权向证人、鉴定人发问。当事人在证人、鉴定人提供鉴定结论后，认为有些事实还不清楚，需要询问证人、鉴定人的，经审判长许可，可以对证人、鉴定人进行发问，要求其作出进一步的陈述和说明。
4、当事人对公诉人、辩护人向法庭出示的物证有辨认的权利。对公诉人向法庭出示的证明被告人罪行的物证，辩护人向法庭出示的证明被告人无罪或罪轻的物证，当事人都有权进行辨认、核实，经过辨认后，发表自己对这些证据证明力的看法。对法庭上出示的物证和宣读的其他证据，只有经过当事人辨认，各方面的证人证言相互印证，核对属实后，方可作为定案的根据。
5、当事人有权申请通知新的证人到庭，调取新的物证，申请重新鉴定或勘验。在法庭调查过程中，当事人如果发现了新的证据或对原有证据产生疑问，认为有必要重新取证或进行补充的，有权以口头或书面形式随时向法庭提出申请，请求新的证人到庭，调取新的物证，进行重新鉴定或勘验。但是否允许申请，还要人民法院作出决定。人民法院如认为有必要，可以向有关单位或个人调取新的证据材料，也可以向人民检察院调取在侦查、审查起诉中收集的有关证据材料。人民检察院应在自收到人民法院要求调取证据材料决定书后3日内移交。
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