根据我国关于人身损害的民法原则，《医疗事故处理条例》提出了确定医疗事故具体赔偿的4个基本原则：
1、与具体案件的医疗事故等级相适应。医疗事故分为四级，确定赔偿的具体数额不仅要考虑医疗事故属于哪一级别，还要考虑到属于某一级别的哪一个等级。不同级别的医疗事故的赔偿数额不一样，同一级别中不同等级的医疗事故，其赔偿的具体数额也不一样。
2、与医疗过失行为在医疗事故损害中的责任程度相适应。确定医疗事故的赔偿责任，首先必须确定医疗行为本身是否有过错，有过错才可能承担责任，没有过错不承担赔偿责任。有过错也不意味着承担全部责任，还要看过错行为对损害方损害结果所占的责任程度大小，有多大的责任就承担多大的赔偿责任。
3、客观考虑患者原有疾病状况与损害后果的关系。包括患者原有疾病状况在发展过程中的必然趋势与医疗事故损害后果的关系；患者原有疾病状况发展对现存损害后果的直接作用程度及与过失行为之间的关系；患者原有疾病状况的基础条件在静止状态与其现有损害的关系，如果是一个相当于x级的残疾者，而医疗事故导致其残疾程度进一步严重，在确定具体赔偿数额时应当减除原有残疾损失的份额；患者原有疾病状况的危险性及其与医疗主体实施医疗行为的必然联系和客观要求，患者因医疗行为的获益结果与损害结果的关系等；
4、不属于医疗事故，医疗机构不承担赔偿责任。医疗主体只对因自己过错直接造成的患者人身损害承担赔偿责任，而对非医疗事故责任导致患者在接受治疗过程中，与医疗措施有关的其他损害后果不承担赔偿责任。
无论多少复杂的医疗纠纷，获得相应的医疗事故赔偿是患方的最终目的。也就是说，赔偿是整个医疗事故处理的核心问题。如果这个核心问题得不到客观、公正处理，医患双方因医疗事故引发的纠纷就会没完没了地闹下去。新《条例》使这一问题得以定性和初步量化。
医疗事故赔偿确认要经过五个步骤，
1、鉴定医疗事故。医疗事故可通过三条途径解决：双方自行协商、向卫生行政部门提出处理申请或向人民法院提起诉讼。解决的关键在于医疗事故的技术鉴定，医疗事件先由医院所在辖区的区县医学会进行首次鉴定；当事人对首次鉴定结论不服的，可提出再次鉴定的申请，市医学会负责组织鉴定；如果对再次鉴定结论仍不服，可向法院提起诉讼，由法院最终判决。北京首次（区级）鉴定费是3000元，再次（市级）鉴定费是3500元，属医疗事故鉴定费由医院承担，非医疗事故鉴定费由患方承担。
2、由医学会给出医疗事故鉴定报告。报告通常包括三个层次，一、是否属医疗事故。
二、属几级医疗事故（一级医疗事故：造成患者死亡、重度残疾的；二级医疗事故：造成患者中度残疾、器官组织损伤导致严重功能障碍的；三级医疗事故：造成患者轻度残疾、器官组织损伤导致一般功能障碍的；四级医疗事故：造成患者明显人身损害的其他后果的）。
三、医疗人员负有哪种责任（完全责任，医疗机构承担100%的赔偿责任；主要责任承担70%的赔偿责任；次要责任，承担30%的赔偿责任；轻微责任，承担10%的赔偿责任）。
3、根据《条例》规定的11项标准计算的医疗事故赔偿基数。
4、计算赔偿总额。计算公式为：赔偿总额=上述11项所加总额医疗过失行为责任程度的赔偿比例。
5、保险公司或医疗机构根据确定的赔偿总额给予赔付。
从五个步骤可以看出，在新《条例》下，医疗事故的实际赔偿金额是下无底线，上不封顶的。
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