1、所侵犯的客体不同。本罪所侵犯的是市场管理的正常活动及费者的合法权益，包括其人身健康及财产安全等权利；而诈骗罪则是对财产的所有权造成侵害。
2、犯罪目的不同。本罪一般表现为以获取非法利润为目的，但也可以是出于其他非法目的，如为了不正当竞争，通过生产、销售伪劣产品冒充为他人生产的产品，毁坏他人名誉，以使自己处于有利的地位等；而后者则只能出于非法占有的目的。
3、客观行为的表现方式不同。诈骗罪是完全采取虚构事实、隐瞒真相的方法，使受害人产生错觉，信以为真，从而自愿地“交出财物”，而本罪则是在经济活动中，违反工商管理等市场管理法规，在生产、销售等工商活动中使用偷工减料、掺杂使假，以次充好，以假充真，以不合格产品冒充合格产品等带有欺诈性质的手段进行非法的经营活动。
虚报注册资本本身就含有欺诈的手段，即骗得虚报注册，骗取公司登记，但就其构成而言，与诈骗罪不同。这主要体现在下列四个方面：
1、犯罪客体不同。虚报注册资本罪侵犯的是公司登记管理制度， 属于妨害对公司、企业的管理秩序一类犯罪，而诈骗罪侵犯的是公私财产所有权。
2、犯罪客观方面不同。 虚报注册资本罪只能发生在申请公司登记的过程中，采用种种欺诈手段虚报注册资本，骗取公司登记，犯罪对象是公司登记主管部门，而并不直接与财物发生关系。诈骗罪则可以发生在任何情况下，只要行为人隐瞒事实真相或者虚造假象，骗取他人财物的即构成犯罪。
3、犯罪主体不同。 虚报注册资本罪的主体是特殊主体，即申请公司登记的人或者单位，诈骗罪的主体是一般主体，而且只能是自然人。
4、主观方面不同。两罪虽然都是故意犯罪， 但虚报注册资本罪的目的是以欺诈手段虚报注册资本，骗取公司登记，而诈骗罪的目的是骗取公私财物。当然此类案件不能一概而论，而应根据不同案件的具体情况加以斟别，确定罪名。
如果行为人为了骗取财物，以虚报注册资本骗取公司登记为手段，获得他人信任，骗取贷款或者其他财物后逃遁，虚报注册资本的手段行为与诈骗的目的行为构成牵连关系，按照刑法理论上处理牵连犯从一重处断的原则，对行为人以诈骗罪论处；如果行为人虚报注册资本时就是为了骗取公司登记，没有骗取他人财物的故意，后来在经营活动中产生骗取他人财物的主观意图并实施诈骗活动，不存在一个犯罪意图下的手段行为与目的行为的牵连关系，则应以虚报注册资本罪和诈骗罪分别定罪，二罪并罚。
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