在医疗诉讼实践中，患方常以医疗机构违反“医疗服务合同”为由起诉，根据我国诉讼法的规定，如果是因“医疗合同纠纷”提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。也就是说，医疗机构所在地的法院可以管辖；也可以是合同履行地（手术的实施地、错误使用药物地、错误实施治疗地等）。
诉讼法和《合同法》又规定：合同的当事双方是可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖。也就是说，医疗纠纷双方当事人在签订医疗合同前可以以书面形式约定管辖法院。
此外，诉讼法规定：因侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。比如说，患者及其家属到甲区的A医院就医，但是，按照A医院的规定，做手术应当到该医院设在乙区的分院治疗，结果在手术过程中生产医疗纠纷，那么，患者及其家属可以选择甲区的法院，或者乙区的法院作为管辖法院进行诉讼。
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。
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