基层人民法院管辖第一审医疗纠纷民事诉讼案件；
中级人民法院管辖在本辖区有重大影响的医疗纠纷民事诉讼案件；
高级人民法院管辖在本辖区有重大影响的第一审医疗纠纷民事诉讼案件。
对公民提起的医疗纠纷民事诉讼诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。
同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。
因医疗侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖
因医疗合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖，但不得违反本法对。
上级人民法院有权审理下级人民法院管辖的第一审医疗纠纷民事诉讼案件，也可以把本院管辖的第一审案件交下级人民法院审理。
下级人民法院对它所管辖的第一审医疗纠纷民事案件，认为需要由上级人民法院审理的，可以报请上级人民法院审理。
在通常情况下，医疗纠纷诉讼案件，由医疗机构所在地基层人民法院一审，上诉案件由该基层法院的上级中级人民法院二审。诉讼标的较大的或有其他重大影响的案件，由医疗机构所在地中级人民法院一审，高级人民法院二审。
医疗纠纷民事诉讼被告的诉讼权利，是指赋予民事诉讼中被告在诉讼过程中所享有的权利。作为一方当事人的被告，只有了解自己在诉讼中拥有的诉讼权利，才能合法地充分维护自身的合法权益。
民事诉讼中，原被告的诉讼权利基本对等，一方面，原告拥有提起诉讼、放弃、变诉讼请求等诉讼权利，相对应的，被告在诉讼过程中则拥有反驳原告的诉讼请求及提起反诉的权利。
反驳原告的诉讼请求是被告的重要诉讼权利，也是庭审中被告的主要任务，一般通过列举事实和理由，对原告用以证明其诉讼请求的证据提出质疑，举出证据证明原告的诉讼请求不成立等，达到全部或部分否定原告主张的事实和理由的诉讼目的。
提起反诉是民事诉讼中被告的另一重要诉讼权利，指在已经开始的民事诉讼程序中，被告向本诉的原告提出一个独立的反请求，目的是为了抵消或吞并本诉原告的诉讼请求。反诉中，本诉的被告作为原告，而本诉的原告则成为被告。
里举一个案例进行说明：王某因双侧卵巢肿块入住某医疗机构做腹腔镜手术，医疗机构手术过程中误结扎了其双侧输尿管，后不得不做输尿管再植手术，并造成肾功能一定程度的损害。王某以侵权为由起诉该医疗机构，医疗机构在应诉过程中，则提起反诉，诉称王某尚欠医疗机构治疗原发病的医疗费用。这是医疗纠纷中常见的提起反诉的情形，原告（）以侵权提起诉讼，被告（医疗机构）以患者拖欠医疗费用等提起反诉。
此外，医疗纠纷民事诉讼中，原、被告的诉讼权利多数是相同的，如：均有委托诉讼代理人代理自己进行诉讼活动的权利；在某些情形下，均有申请、书记员、、鉴定人、勘验人回避的权利；诉讼过程中，均有进行陈述、质证和辩论的权利；诉讼过程中，均有查阅和复制与案件有关的材料和法律文书的权利；均有请求法院予以调解，或与对方当事人自行和解的权利；均有收集和提供证据的权利；均有使用本民族语言、文字进行诉讼的权利；均有在法庭许可的情况下，向证人、鉴定人、勘验人发问的权利；均有要求重新调查、鉴定或者勘验的权利；均有向人民法院申请采取财产保全措施的权利；均有阅读庭审笔录并签名的权利，有对自己陈述记录有遗漏和差错的地方进行补正的权利；均有对一审判决或裁定不服，在法律规定期限内上诉的权利，对已生效的判决、裁定、调解协议认为确有错误，向原审人民法院或者上一级人民法院申诉的权利等。
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