合作开发合同是技术开发合同中的一种开发形式，区别于委托开发合同，合作开发合同是当事人各方为共同进行研究开发所订立的合同。合作开发合同成立后各方当事人必须忠实履行以下义务：
第一，按照约定进行投资，包括以技术进行投资。这是合作开发各方当事人最基本的义务。这里所称的投资，是指当事人以提供资金、设备、材料、场地、试验条件、技术情报资料、专利权、非专利技术等方式，对研究开发项目所作的投入。
第二，分工参与研究开发工作。合作开发的各方当事人均有进行研究开发的权利和义务。各方当事人应依合同约定的分工，参与研究开发工作。
第三，协作配合研究开发工作。合作研究的各方当事人应按照合同的约定相互协作配合，以保证研究开发工作的顺利进行。
此外，各方当事人应依诚实信用原则，对合作开发过程中取得的技术成果以及对方提供的相关情报资料承担保密义务。如果当事人没有诚实信用地履行上述的法定或者约定义务，则必须承担相应的违约责任：
第一，合作开发合同的任何一方违反合同，造成研究开发工作停滞、延误或者失败的，应当支付违约金或者赔偿损失。
第二，合作开发合同的任何一方逾期一定期间不进行投资或者不履行其他约定的，另一方或者其他各方有权解除合同，违约方应当赔偿因此给他方造成的损失。
由于技术开发存在着的风险，风险一旦出现，将使技术开发合同无法履行，给当事人造成损失。因此，当事人应当在订立合同时明确约定风险责任的承担。如果当事人在合同中没有约定或者约定不明确，风险发生后，当事人可能协议补充。不能达成补充协议的，可以按照合同的有关条款或者交易习惯确定，仍不能确定，风险责任由当事人合理分担。
在研究开发过程中，当事人一方发现可能导致研究开发失败或者部分失败的情况时，应当及时通知另一方并采取适当措施减少损失。合同法明确规定这是技术开发合同当事人的义务。如果当事人未能及时通知对方当事人，也未能及时采取措施，制止损失的扩大，应当就扩大的损失承担责任。
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