顶楼住户开孔上天台的行为是否违法，需要根据实际情况及相关法律规定进行核实确定。天台属于该栋全部业主所有的，如果顶楼住户开孔上天台的，顶楼住户的行为违法，该栋楼房的全体业主有权要求顶楼停止其侵权行为，造成损失的，有权要求其承担相应的赔偿责任，如果顶楼属于顶楼住户所有的，对于顶楼住户开孔上天台的行为，顶楼住户的行为合法，受到法律保护。
《民法典》第二百七十二条，业主对其建筑物专有部分享有占有、使用、收益和处分的权利。业主行使权利不得危及建筑物的安全，不得损害其他业主的合法权益。
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