仓管员对不上账是否需要赔偿要根据具体情况分析：
如果对方有证据证明是因为仓管员的失职造成的对不上账，那么仓管员是需要赔偿的。所以仓管员是否需要承担责任需要根据其是否尽到相关责任来判断。
《中华人民共和国民法典》第九百一十七条，储存期内，因保管不善造成仓储物毁损、灭失的，保管人应当承担赔偿责任。因仓储物本身的自然性质、包装不符合约定或者超过有效储存期造成仓储物变质、损坏的，保管人不承担赔偿责任。
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