办理商标使用许可备案步骤如下：
(一)申请人直接到商标注册大厅办理商标注册申请的，申请人可以按照以下步骤办理：准备申请书 → 在商标注册大厅受理窗口提交申请书→ 在打码窗口打收文条形码→ 在交费窗口缴纳备案规费→领取商标使用许可合同备案通知书。
(二)委托商标代理机构办理商标使用许可合同备案的，申请人可以自愿选择任何一家国家认可的商标代理机构办理。所有在商标局备案的商标代理机构都公布在“代理机构”一栏中。
《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十九条，商标使用许可合同未经备案的，不影响该许可合同的效力，但当事人另有约定的除外。
商标使用许可合同未在商标局备案的，不得对抗善意第三人。
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