专利代理人在为发明人代理专利事务的过程中要履行一定的义务，专利代理人对在业务活动中所了解的发明人的发明创造，除专利申请已经公布或者公告的意外，有保守秘密的责任。除此之外，专利代理人不得代理利益冲突的上方当事人，如许可人与被许可人、出让人与受让人、侵权人与被侵权人等，此项义务与一般代理中的代理人不得双方代理义务是一致的。
《专利代理条例》第四条：专利代理机构和专利代理师执业应当遵守法律、行政法规，恪守职业道德、执业纪律，维护委托人的合法权益。
专利代理机构和专利代理师依法执业受法律保护。
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