软件著作权的认定是：
1.原创软件的登记，是软件开发者通过最初始的开发活动完成的软件；
2.二次开发软件的登记，软件开发者通过合法的开发活动，在原有软件的基础上完成的新软件；
3.计算机软件著作权归属于自然人；
4.由两个以上的自然人、法人或者其他组织合作开发的软件，著作权的归属应在合作开发者签订的书面合同中约定。
根据《著作权法》第七条，国务院著作权行政管理部门主管全国的著作权管理工作；各省、自治区、直辖市人民政府的著作权行政管理部门主管本行政区域的著作权管理工作。
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