法院对于另案处理的，会在其本案的判决书上予以标明另案处理的情况，之后对其另案审理的案件单独审理或者与其它案件合并审理，经过审判之后在对其犯罪嫌疑人予以判决。
可能是有的犯罪嫌疑人在逃未归案而无法并案处理，或者可能是在某些刑事案件中，部分犯罪嫌疑人由于年龄、刑事责任能力等方面的原因，不负刑事责任，需要“另案处理”。
涉案的部分犯罪嫌疑人有下列情形之一的，可以适用“另案处理”：
1、依法需要移送管辖处理的；
2、系未成年人需要分案办理的；
3、在同案犯罪嫌疑人被提请批准逮捕或者移送审查起诉时在逃，无法到案的；
4、涉嫌其他犯罪，需要进一步侦查，不宜与同案犯罪嫌疑人一并提请批准逮捕或者移送审查起诉，或者其他犯罪更为严重，另案处理更为适宜的；
5、涉嫌犯罪的现有证据暂不符合提请批准逮捕或者移送审查起诉标准，需要继续侦查，而同案犯罪嫌疑人符合提请批准逮捕或者移送审查起诉标准的；
6、其他适用“另案处理”更为适宜的情形。
《关于规范刑事案件“另案处理”适用的指导意见》第二条，本意见所称“另案处理”，是指在办理刑事案件过程中，对于涉嫌共同犯罪案件或者与该案件有牵连关系的部分犯罪嫌疑人，由于法律有特殊规定或者案件存在特殊情况等原因，不能或者不宜与其他同案犯罪嫌疑人同案处理，而从案件中分离出来单独或者与其他案件并案处理的情形。
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