审查股权转让协议是否合法有效，应着重审查以下几点：
(1)股东转让的股权是否真实完整，不存在瑕疵。
(2)转让人与受让人就转让事宜意思表示是否真实。
(3)向股东以外的其他人转让出资，是否经过半数以上的股东同意。
(4)是否侵害了其他股东的优先购买权。
法律依据：《企业国有产权转让管理暂行办法》第十九条规定了企业国有产权转让合同应当包括的主要内容，第二十八条规定了报送决定或者批准企业国有产权转让行为的主要审查文件，
第三十二条规定受让方采取欺诈、隐瞒等手段影响转让方的选择以及产权转让合同签订的，国有资产监督管理机构或者企业国有产权转让相关批准机构必要时向法院起诉，确认转让行为无效。
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