公司可以补休的方式来补偿加班。在休息日安排劳动者工作后安排补休的不需要支付加班费，否则支付劳动者不低于工资的百分之二百的工资报酬。在法定节假日和工作日不能以补休的方式来补偿加班，应当依法支付加班费。
《中华人民共和国劳动法》 第四十四条
有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
(一)安排劳动者延长时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
(二)休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
(三)法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
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