分居协议并不能证明婚姻无效。协议其中一项无效不影响其余有效条款的成立，分居协议在离婚时只能作为证明双方分居多久的证明。婚姻无效的情形有：
（一）重婚；
（二）有禁止结婚的亲属关系；
（三）未到法定婚龄。
《民法典》第一千零五十一条，有下列情形之一的，婚姻无效：
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