辞职老板扣工资是不合法的。
我国法律规定，用人单位不得无故克扣劳动者的工资，如果劳动者没有给用人单位造成损失的，劳动者离职时不能克扣劳动者工资。
《违反<劳动法>有关劳动合同规定的赔偿办法》第四条，劳动者违反规定或劳动合同的约定解除劳动合同，对用人单位造成损失的，劳动者应赔偿用人单位下列损失：
(一)用人单位招收录用其所支付的费用；
(二)用人单位为其支付的培训费用，双方另有约定的按约定办理；
(三)对生产、经营和工作造成的直接经济损失；
(四)劳动合同约定的其他赔偿费用。
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