员工旷工一天扣三天工资不合法。因为劳动者旷工一天可以扣当天的工资，如果扣三天工资则多扣的两天就涉嫌克扣工资；
而我国《劳动法》又规定，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，所以工旷工一天扣三天工资不合法。
《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
温馨提示：
