医院合同工按正常程序一般不需要支付违约金，但违反服务期约定、保密义务和竞业限制条款应当按照规定支付违约金，其他情形造成医院损失的，只需要承担赔偿责任，不需要支付违约金。
《中华人民共和国劳动合同法》第二十五条除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
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