个人缴纳社保从工资里扣，根据《劳动部关于印发<工资支付暂行规定>的通知》中有明确规定，用人单位可以从工资中代扣应由劳动者个人负担的各项社会保险费。
《劳动部关于印发<工资支付暂行规定>的通知》第十五条
用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
(一)用人单位代扣代缴的个人所得税；
(二)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
(三)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
(四)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
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