1、股份公司股东同股同权、同股同利，每一股权平等。而有限公司却可以不相同，有限责任公司的资本不分为等额股份，股东拥有多少权利主要看其在公司的出资数额或出资比例的高低。这种“资本多数决”的方式本质上与股份公司是相同的。所不同的是，出资多少不是决定股东地位高低的唯一因素。公司法允许股东通过制定或修改公司章程的方式自由约定股东如何行使权利。
2、证明股东身份的法律凭证不同：在股份有限公司中，股票是股份公司股东身份的凭证，也是股东在公司拥有多少表决权的象征。而有限责任公司的资本总额不作等额划分，股东的股权通过投资占总资本比例大小由公司开具出资证明来表示。出资证明书是有限公司股东享有股东权的重要凭证。
3、股权转让的差别：有限公司以限制转让为原则，自由转让为例外，股权不能自由流通。股份公司以自由转让为原则，限制转让为例外，股份可以自由流通。股份公司的股东购买公司股票后一般也不得要求公司退回，但可自由转让，具有充分的流通性。
4、股东知情权的差异：根据新《公司法》第九十八条的规定，股份有限公司的股东有权查阅公司章程、股东名册、公司债券存根、股东大会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议、财务会计报表。并未规定有公司会计帐簿的查阅权，这是有限责任公司的股东和股份有限公司的股东在知情权上存在的最大差异。
5、股份公司股东无权制定章程，只能参与修改章程。有限责任公司有权制定公司章程的主体是全体股东。公司成立以后，股东可以通过形成股东会表决修改章程。
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