无合同员工擅自离职，用人单位正确的处理方法是：
1、查清事实，取得证据。单位对职工所犯错误的事实应进行深入细致的调查取证，并且对所取得的证据要严格审核；
以保证确凿无误，结论材料应与本人见面，允许其申辩，如确属于事实不符，应当纠正。
2、发出书面通知。单位可向劳动者发出书面通知(挂号信等形式)，表明员工已经有多少天无故未到岗上班；
限定员工在某个时间内回单位报道，否则将按旷工处理，单位将依据规章制度某某条与其解除劳动合同。
3、解除(终止)程序。给员工下发解除(终止)劳动合同通知书，(注明解除(终止)劳动合同的事由)。
《劳动合同法》第五十条，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明；
并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。
用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
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